분자 구조 탐색기
BIOVIA CTfile Formats 2020의 제한된 V2000 범위에 맞는 로컬 MOL/SDF 파일을 엽니다. 원자와 결합, 최대 8개 SDF 레코드를 살피고 실제 z 좌표가 있을 때만 3D 투영을 회전합니다. 경고는 미지원 정보와 해석 한계를 드러낼 뿐 화학적 타당성을 판정하지 않습니다.
주요 기능
- V2000 고정 폭 원자·결합 좌표와 M CHG 전하 읽기
- 파일을 서버에 보내지 않고 최대 8개 SDF 레코드 선택
- 2D 그림 또는 제공된 x/y/z 좌표의 3D 투영 회전
- 키보드로 조작 가능한 원자·결합 세부 정보 선택
- 미지원 원소·입체·동위원소·무시된 자료·간이 원자가 초과 경고
- 선택 레코드의 원본 MOL 블록, 좌표 SVG, 버전 표시 JSON 보고서 저장
사용 방법
- .mol/.sdf 파일을 고르거나 형식을 지정해 원문을 붙여 넣습니다. 독립 작성한 물 예제로 시작해도 됩니다.
- SDF가 여러 레코드를 포함하면 하나를 선택하고 원자·결합 수와 경고를 확인합니다.
- 2D를 보거나 z 좌표에 차이가 있을 때 3D를 선택해 요·피치 슬라이더로 제공된 좌표만 회전합니다.
- 원자·결합 버튼으로 번호, 원소, 전하, 좌표, 결합 차수와 해석하지 않은 입체 플래그를 확인합니다.
- SVG, 선택된 V2000 MOL 블록 또는 JSON 보고서를 내려받습니다. 손상·미지원 입력은 현재 화면을 바꾸지 않습니다.
활용 예시
- 수업에서 작은 로컬 V2000 MOL 그래프 살펴보기
- 콘포머를 생성하지 않고 2D 배치와 제공된 3D 좌표 비교하기
- SDF 모음의 여러 레코드 선택해 보기
- 전문 프로그램에 넘기기 전 미지원 기호와 표시하지 않은 입체 정보 확인하기
자주 묻는 질문
2D 파일로 3D 구조를 계산하나요?
아니요. 입력 원자 중 z 좌표가 0이 아닌 것이 있을 때만 3D 버튼이 활성화됩니다. 제공된 좌표를 직교 투영해 회전할 뿐 콘포머를 생성·최적화·측정·인증하지 않습니다.
어떤 CTfile 정보를 지원하나요?
BIOVIA CTfile Formats 2020 V2000의 제한된 뷰어입니다. 고정 폭 원자 좌표, 원소 기호, 단일~삼중 결합과 방향족 4번 결합, 구형 원자 전하 코드와 M CHG를 읽습니다. V3000, 질의 원자 목록·결합, R 그룹, Sgroup, 기타 속성 행은 거부합니다. SDF 자료 필드는 해석하지 않습니다.
원자가·입체 경고는 무엇을 뜻하나요?
원자가 경고는 일부 중성 원소의 표시된 결합 차수 합을 대략적인 최대치와 비교할 뿐입니다. 암시적 수소, 전하, 방향족성, 공명, 예외적 원자가를 분석하지 않습니다. 입체 플래그는 숫자로 보존하지만 입체 배치를 그리거나 검증하지 않습니다. 어느 경고도 타당성 판정이 아닙니다.
미지원 원소는 어떻게 되나요?
올바른 원소형 기호가 이 뷰어의 흔한 표시 목록 밖이면 노란색 기호와 경고로 남깁니다. 해당 성질이나 원자가를 추론하지 않습니다. 가상 원자·질의 기호는 원소로 잘못 처리하지 않고 입력을 거부합니다.
저장된 MOL이 원본 SDF와 같나요?
MOL 저장에는 선택 레코드의 원본 헤더·원자·결합·허용된 M CHG 행부터 M END까지 들어갑니다. SDF 자료 필드와 다른 레코드는 빠지며 화면에 이를 알립니다. SVG/JSON은 뷰어 출력으로 완전한 화학 교환 형식을 대체하지 않습니다.
의료·독성·화학적 결정에 써도 되나요?
아니요. 교육용 로컬 좌표·그래프 표시입니다. 물질 동일성, 화학적 타당성, 생물학적 영향, 독성, 안전성, 합성 적합성을 판정하지 않습니다. 그런 판단에는 검증된 전문 도구가 필요합니다.
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